# Publications Scientifiques

## Moteurs de recherche

* https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed
* https://www.medrxiv.org

## Sélection d'articles par Reacting

« REACTing shares a selection of the most relevant articles published on COVID-19 on a weekly
  basis. This literature review not only presents a selection of references, but also highlights the
  key points and messages from each article. **It does not include pre-print articles.** »

https://reacting.inserm.fr/literature-review

## Sélection en vrac

* Impact of non-pharmaceutical interventions (NPIs) to reduce COVID-19 mortality and healthcare demand /
  Neil M Ferguson et al. /
  Imperial College COVID-19 Response Team

  * https://www.imperial.ac.uk/mrc-global-infectious-disease-analysis/covid-19
  * https://www.imperial.ac.uk/media/imperial-college/medicine/sph/ide/gida-fellowships/Imperial-College-COVID19-NPI-modelling-16-03-2020.pdf

* Aerosol and surface stability of HCoV-19 (SARS-CoV-2) compared to SARS-CoV-1 /
  Neeltje van Doremalen et al.

  * https://www.medrxiv.org/node/73543.external-links.html
  * doi: https://doi.org/10.1101/2020.03.09.20033217
  * https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMc2004973

* Neutralizing antibody responses to SARS-CoV-2 in a COVID-19 recovered patient cohort and their implications

  https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.03.30.20047365v1

* Structural and molecular modeling studies reveal a new mechanism of action of chloroquine and hydroxychloroquine against SARS-CoV-2 infection

  https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7128678/

* Should chloroquine and hydroxychloroquine be used to treat COVID-19? A rapid review

  https://bjgpopen.org/content/early/2020/04/07/bjgpopen20X101069.long

## Séquençage du génome

* Base de données génomique [Global Initiative on Sharing Avian Influenza Data](https://www.gisaid.org)

* https://nextstrain.org/ncov Outil bioinformatique basé sur les données de GISAID

  « Nextstrain is an open-source project to harness the scientific and public health potential of
    pathogen genome data. We provide a continually-updated view of publicly available data alongside
    powerful analytic and visualization tools for use by the community. Our goal is to aid
    epidemiological understanding and improve outbreak response. »

  Arbre phylogénique https://nextstrain.org/ncov/global?l=unrooted&m=div

  Cela donne une idée sur la propagation spatial et temporel (chaîne de transmission) du virus en
  associant position physique des personnes infectées et des mutations du génome.  Attention l'arbre
  peut être faussé si un maillon de la chaîne n'a pas été séquencé.

# Données Statistiques

## Données Covid19

* Coronavirus COVID-19 Global Cases by the Center for Systems Science and Engineering (CSSE) at Johns Hopkins University (JHU)

  https://www.arcgis.com/apps/opsdashboard/index.html#/bda7594740fd40299423467b48e9ecf6

* [Dipartimento della Protezione Civile](http://www.protezionecivile.gov.it/home)

  http://opendatadpc.maps.arcgis.com/apps/opsdashboard/index.html#/b0c68bce2cce478eaac82fe38d4138b1

## Autres Données INSEE etc.

* https://www.ined.fr/fr/tout-savoir-population/chiffres/france/mortalite-cause-deces/deces-sexe/

  https://www.insee.fr/fr/statistiques/2383440#tableau-figure1

  Mortalité 2019 ~ 612k soit 9/1000 habitans

* Naissances et taux de natalité https://www.insee.fr/fr/statistiques/2381380#tableau-figure1

  Naissances 2019 ~ 753k

* https://www.ined.fr/fr/tout-savoir-population/chiffres/france/mortalite-cause-deces/causes-deces/

  données détaillées http://cepidc-data.inserm.fr/cgi/broker.exe